Перезалив папки administrator действительно проблемы не решил 🙁
Логика прослеживалась, если бы с самого начала шаблон с Joomla устанавливался с такими проблемами.
Но quickInstall, с ранней версией Joomla, ставится без ошибок в кодировке, а уже после обновления на крайнюю версию, "теряет" кодировку, но исключительно в разделе "Модули".